C'est en 1987, quand un groupe de résidants et de résidantes des différents quartiers de la Municipalité se réunissent avec comme objectif de constituer une nouvelle mairie indépendante. Cette même année, dans les élections municipales, une candidature appelée "Zierbena Unie" réussit à introduire un conseiller à la mairie d'Abanto.

Le 24 mars 1991, les habitants de Zierbena se prononcent sur la ségrégation lors d'un référendum avec 91% de soutien. Au regard de cela, la Députation articule les mesures pour la constitution d'une nouvelle Municipalité, qui est approuvée lors des Assemblées Générales de Gernika et entrent en vigueur en 1993. Cette même année néanmoins, en février, la Mairie d'Abanto présente un recours auprès du Tribunal Supérieur de Justice du Pays Basque et celui-ci suspend la désannexion parce qu'il manque un rapport obligatoire du Conseil d'État.

Après plusieurs débats politiques et processus judiciaires, finalement, le 9 novembre 1994, les Assemblées Générales approuvent la ségrégation de Zierbena, célébrant ainsi les premières élections municipales le 15 octobre 1995.

Depuis 1995, tous les ans, la Municipalité de Zierbena a une festivité de plus dans son calendrier.